ナショナル・バイオリソース・プロジェクト
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オルソログ対応
XenOrtho DB (Xenopus Ortholog DataBase) はネッタイツメガエル、アフリカツメガエル 、およびヒトの遺伝子のオルソログ対応関係がリストされているデータベースです。それぞれのゲノム塩基配列に対して SyMAP4.0 によるシンテニーマッピング(種間で遺伝子の並びが同じ染色体領域の同定)を行い、各種の対応するシンテニーに含まれる遺伝子を網羅的にホモロジー検索し、相同性の高い遺伝子をオルソログとしてリスト化しました。
NBRP ネッタイツメガエルの事業として公開していますが、これには中央大・福井教授の多大なご協力をいただいています。
本データベースに使用される用語に関しては SyMAP 4.2 Tour(外部リンク)が参考になります。その他使用に関してのご質問は井川(詳細は左サイドバー「内容別お問い合わせ先」参照)にお問い合わせください。
XenOrtho DB(外部リンク)作製:福井 彰雅 博士(XCIJ, 中央大学理工学部)・井川 武 博士(NBRP ネッタイツメガエル, 広島大学両生類研究センター)
当プロジェクトについて
ツメガエル対ヒト
オルソログ対応
本データベースを利用して研究発表された際には上記の両博士およびXCIJ1 と NBRP2 への謝辞を論文等に記載していただくことをお願いいたします。
1 日本ツメガエル研究会
2 ナショナルバイオリソースプロジェクト
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カエル・DNA など
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