ナショナル・バイオリソース・プロジェクト

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オルソログ対応

XenOrtho DB (Xenopus Ortholog DataBase) はネッタイツメガエル、アフリカツメガエル 、およびヒトの遺伝子のオルソログ対応関係がリストされているデータベースです。それぞれのゲノム塩基配列に対して SyMAP4.0 によるシンテニーマッピング（種間で遺伝子の並びが同じ染色体領域の同定）を行い、各種の対応するシンテニーに含まれる遺伝子を網羅的にホモロジー検索し、相同性の高い遺伝子をオルソログとしてリスト化しました。

NBRP ネッタイツメガエルの事業として公開していますが、これには中央大・福井教授の多大なご協力をいただいています。

本データベースに使用される用語に関しては SyMAP 4.2 Tour（外部リンク）が参考になります。その他使用に関してのご質問は井川（詳細は左サイドバー「内容別お問い合わせ先」参照）にお問い合わせください。

XenOrtho DB（外部リンク）作製：福井 彰雅（XCIJ, 中央大）・井川 武（NBRP ネッタイツメガエル, 広島大）

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    オルソログ対応

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