ナショナル・バイオリソース・プロジェクト

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オルソログ対応

XenOrtho DB (Xenopus Ortholog DataBase) はネッタイツメガエル、アフリカツメガエル 、およびヒトの遺伝子のオルソログ対応関係がリストされているデータベースです。それぞれのゲノム塩基配列に対して SyMAP4.0 によるシンテニーマッピング(種間で遺伝子の並びが同じ染色体領域の同定)を行い、各種の対応するシンテニーに含まれる遺伝子を網羅的にホモロジー検索し、相同性の高い遺伝子をオルソログとしてリスト化しました。

NBRP ネッタイツメガエルの事業として公開していますが、これには中央大・福井教授の多大なご協力をいただいています。

本データベースに使用される用語に関しては SyMAP 4.2 Tour(外部リンク)が参考になります。その他使用に関してのご質問は井川(詳細は左サイドバー「内容別お問い合わせ先」参照)にお問い合わせください。

XenOrtho DB(外部リンク)作製:福井 彰雅(XCIJ, 中央大)・井川 武(NBRP ネッタイツメガエル, 広島大)

  1. 当プロジェクトについて

  1. ツメガエル対ヒト
    オルソログ対応

利用して研究発表された際には XCIJ1 と NBRP2 への謝辞を論文等に記載していただくことをお願いいたします。

1 日本ツメガエル研究会

2 ナショナルバイオリソースプロジェクト

  1. ユーザー交流

  1. ノウハウの提供

  1. カエル・DNA など
    バイオリソースの提供

ネッタイツメガエル

収集・保存・提供

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